いろいろな経営指導をフランチャイズ本部は、加盟店に対して開業前、開業後と分けて行う。
まず、本部は加盟店のオーナー、店長、従業員に対して、開業前、教育・訓練を本部の研修センター等を使って実施される。
開業時、加盟店の現場などで実施される訓練等は、さまざまな形のプログラムが存在する。
次に、教育や指導は、加盟後継続的に行われるもので、通常、スーパーバイザーが定期的に各加盟店を周り、直接指導を行う。これは、巡回・臨店指導と呼ばれる。また、セミナー・加盟店集合研修・技術講習会・オーナー懇親会などの実施もある。
情報メディアも利用されるようになり、経営指導は、規模が大きくなるにつれ、難度も高くなり、その機能そのものが重要視されてきている。